蘋果SE3存在一些較為明顯的缺點，以下是對其嚴重缺點的歸納：首先，屏幕尺寸較小，僅為4.7英寸，這在當前大屏手機盛行的市場下，可能會讓用戶在觀看視頻或玩游戲時感到視野受限，且長時間使用容易導致眼疲勞。其次，電池續航能力一般，無法滿足部分用戶一整天的使用需求，對于經常外出的用戶來說，可能需要頻繁充電，影響使用體驗。此外，蘋果SE3的屏幕分辨率也不盡如人意，圖案邊緣可能存在模糊現象，影響視覺體驗。在相機性能上，雖然配置了1200萬像素后置鏡頭，但相比同價位的其他手機，其拍攝效果可能稍顯不足，對于追求高質量攝影的用戶來說，可能會感到失望。另外，蘋果SE3還存在發熱問題，長時間使用后手機會變得非常燙手，影響使用舒適度。同時，它只支持單卡，對于需要雙卡雙待的用戶來說也是一個不便之處。綜上所述，蘋果SE3在屏幕尺寸、電池續航、屏幕分辨率、相機性能、發熱問題以及網絡支持等方面存在一定的缺點。