二次換熱技術在早期由于成本因素及效果不顯著，并沒有得到廣泛的推廣應用。太陽能熱水器的工作原理主要分為直接加熱和間接加熱兩種。間接加熱包括U型管、熱管等類型。直接加熱的過程是陽光透過外玻璃管照射到內管外表面吸熱體上，再將熱量傳遞給內玻璃管內的水。二次換熱，也稱作間接加熱方式，其工作原理是太陽光通過加熱集熱器使流體介質升溫，然后介質通過盤管（通常為銅質）循環，從而將水箱中的水加熱。關于水質問題，直接加熱和間接加熱方式沒有本質的區別。有些人認為間接加熱方式水質更好，可能是由于不理解加熱原理，誤以為集熱器中的水是靜止的死水。實際上，直接加熱方式中的水也是在不斷循環更新的，這是其加熱原理的一部分（通過熱虹吸作用）。如果硬要說直接加熱方式中的水不能飲用，那么通過銅盤管加熱的水就一定能飲用嗎？銅畢竟也屬于重金屬。這些都是商業競爭帶來的誤解。話雖如此，間接加熱系統卻在逐步發展壯大。這并非因為這種方式能改善水質，而是因為它能實現以下幾點：1. 在不同介質之間進行熱交換的同時，防止傳熱介質（如常用的R22）污染我們的飲用水。2. 使系統能夠承壓運行。3. 使用介質進行防凍（如北方地區的平板太陽能熱水器，尤其在工程中，因為平板的保溫性能較差）。