等位基因是位于一對同源染色體相同位置上控制同一性狀的不同形式的基因。比如，控制發色的基因可能有紅色和黑色兩種等位基因。等位基因的顯性和隱性關系決定了其在遺傳中的表現形式。顯性等位基因通常會掩蓋隱性等位基因的表現。在個體中，通常只會表現出顯性等位基因所控制的性狀。非等位基因是指在不同染色體上控制不同性狀的基因。例如，控制有無耳垂的基因Aa和控制有無美人尖的基因Bb，這兩對基因分別位于不同的染色體上，因此它們是非等位基因。非等位基因之間沒有直接的相互作用，它們的表現形式相互獨立。相等基因在生物學上并不是一個常用的概念。在大多數情況下，提到的等位基因指的是同源染色體上的不同形式的基因，而相等基因通常是指完全相同的基因拷貝，這種情況在同源染色體中較為常見。同源染色體上的兩個基因拷貝在大多數情況下是相同的，但也可能攜帶不同的突變。因此，等位基因主要存在于同源染色體上，而非等位基因則存在于非同源染色體上。相等基因這一概念主要用于描述同源染色體上的兩個基因拷貝是否完全相同。非同源染色體上的基因通常是非等位基因，它們控制不同的性狀，且彼此間沒有直接的相互作用。