人文社會科學面對的是有意義關系的事物，它既要研究共同性和普遍性，又要研究個殊性，它不但無法排除而且要研究偶然性、研究意義和價值。研究主體與客體之間并非像自然科學那樣是人與物之間不能溝通只能說明的單向度關系，而是人與人之間可以溝通理解的雙向互動關系。雖然人文社會科學從一開始就與自然科學、理論科學和獨立科學有著“扯不斷、理還亂”的情意結，甚至有著在“科學”層面上的某種同一性或親緣關系，但是，這一切都并不否認其應時而生、發展壯大以及其對科學概念演變至今的豐富涵蓋所作的特殊貢獻。在研究方法上，人文社會科學借鑒和參照了自然科學的一些實證做法，但它又有著完全不同于自然科學的研究對象、研究方法和研究道路。人文社會科學與自然科學一道，共同支撐起完整的科學“大廈”，從而為人類科學事業的繁榮和昌明發揮著自身獨特的無可替代的作用。人文社會科學具有雙重屬性和雙重功能，雙重屬性系指科學性和價值性，雙重功能系指科學認識功能和意識形態功能。一方面，它必須從客觀事實出發，秉執科學的原理和法則，按照科學的邏輯和程序，運用科學的手段和方法，進行科學的認識和實踐，從而得出科學的結論，以保持科學的理論品格，實現科學的認識功能。另一方面，它又以人類自身的文化現象和社會現象為研究對象，因而不可避免地要承擔意識形態功能。如果說自然科學研究自然界，研究事物界必然的因果關系，研究普遍性和共性，排除偶然性、意義和價值的話，那么人文社會科學則研究人界、人及其創造和表達，它不僅要尋求普遍的、共同的規律，而且也研究偶然性和特殊性，并具有價值性。概言之，人文社會科學既是事實科學又是價值科學，是客觀和主觀、真理和價值、事實和規范相匯通相統一的科學。人文科學具有滯后性或后起性。19世紀，實證主義的科學哲學家孔德，按照研究方法將科學由低級到高級的發展經歷描劃為神學、形而上學和實證三個階段，并藉以指出，數學稱得上是所有科學的皇后，最為嚴密完整，物理學已達到實證水平，生物學已進入形而上學階段，而社會學則還處于神學階段。當今世界雖然早已不是孔德所處的時代，人文社會科學更是獲得了空前的發展，但無論研究手段方法還是研究成果水平，都還滯后于自然科學。愛因斯坦在分析物理學與實在的關系時，也曾對科學理論的層次性作過一段精辟的闡述。他指出，科學理論可以分為三級體系，第一級體系是由科學用到的全部原始概念，即那些同感覺經驗直接聯系的概念以及聯系這些概念的命題所組成的經驗知識體系，這種體系的組合還帶有較大的隨便性，屬于低等級低水平的體系。第二級體系是由第一級體系中的原始概念和原始關系按照一定的邏輯規則推導出來的數目較少的概念和關系的一般理論知識體系，這一級體系的建構具有較高的邏輯統一性。第三級體系是由第二級體系中的少數基本概念和關系按照嚴密的邏輯規則推導出來的科學公理體系，它在更深的層次上更加集約和概括地反映了事物的本質和全部，因而離現象世界也更遠。任何一門科學，從初建到成熟，大致都要經歷這三個階段，由第一階段向第二階段的躍升，沿著歸納的路線，屬于粗放型的經驗科學形成過程；由第二階段向第三階段的躍升，沿著演繹的路線，屬于成熟型的理論科學的形成過程。相對而言，現代人文社會科學研究中的絕大多數還大致處于前者水平，而自然科學中的絕大部分研究則已達及后者的高度。綜上所述，人文社會科學是以人、人類社會為研究對象的科學，與自然科學相比，它具有典型的人文特質和社會品性：既具有客觀性又具有主觀性，既具有事實性又具有價值性，既具有真理性又具有功利性（或者說既具有認識世界的功能又具有意識形態的功能），既具有普遍性又具有個殊性，既具有必然性又具有偶然性，既具有理論性又具有規范性，既具有基礎性又具有應用性，既具有實證性又具有實地性，等等。可以說，綜合性是其作為科學之最根本的特性。