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如何分析real-time PCR結果

導讀對于相對定量的實驗,采用SYBR Green染料是常見的方法。內參基因一般選用18S rRNA,而目的基因則根據實驗需求選擇相應的序列。實驗設計中,內參基因包括對照組和實驗組,目的基因也是如此。實驗通常設置三個平行樣本,以確保數據的可靠性和準確性。在數據處理過程中,首先計算每個樣本內參基因和目的基因的平均Ct值。然后,計算目的基因與內參基因之間的相對表達量,即計算△Ct值。具體來說,對于每組樣本,我們用目的基因的Ct值減去內參基因(如18S rRNA)的Ct值,得到△Ct值。接著,我們計算對照組與實驗組之間的相對表達量差異,即△△Ct值。

在學習和應用Real-time PCR技術時,我們常常會遇到如何準確分析實驗結果的問題。當得到的內參和目的基因的Ct值在15-25之間,熔融曲線也是單峰時,這通常表明實驗條件較為理想,但如何解讀這些數據卻需要一定的技巧。對于相對定量的實驗,采用SYBR Green染料是常見的方法。內參基因一般選用18S rRNA,而目的基因則根據實驗需求選擇相應的序列。實驗設計中,內參基因包括對照組和實驗組,目的基因也是如此。實驗通常設置三個平行樣本,以確保數據的可靠性和準確性。在數據處理過程中,我們首先計算每個樣本內參基因和目的基因的平均Ct值。然后,計算目的基因與內參基因之間的相對表達量,即計算△Ct值。具體來說,對于每組樣本,我們用目的基因的Ct值減去內參基因(如18S rRNA)的Ct值,得到△Ct值。接著,我們計算對照組與實驗組之間的相對表達量差異,即△△Ct值。在得出△△Ct值后,我們可以使用2的負△△Ct次方來表示目的基因相對于內參基因的相對表達量變化。如果2的負△△Ct次方等于1,這表明目的基因的表達量沒有顯著變化;如果大于1,則說明目的基因在實驗處理后表達量增加;如果小于1,則表明目的基因表達量減少。值得注意的是,如果內參基因的數據Ct值差異在1以內,可以考慮將所有內參基因的數據取平均,這樣可以進一步提高數據的穩定性和可靠性。除了使用Excel進行數據處理外,還有一些其他軟件可以用于Real-time PCR數據分析,例如Bio-Rad公司的Cq軟件和Quant Studio軟件。這些軟件提供了更便捷和直觀的數據處理功能,可以幫助研究人員更加高效地解讀實驗結果。

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