微波加熱原理涉及一種特定頻率范圍（300 - 300000兆赫）的電磁波，家用微波爐與微波消解儀所用的微波頻率相同，均為2450兆赫。含有水分或酸的體系具有極性，在微波電場的作用下，分子以每秒24.5億次的速率改變正負方向，導致高速碰撞和摩擦，從而產生熱量。微波電場還促使溶液中的離子定向流動，形成離子電流，離子在流動過程中與周圍分子和離子發生碰撞，進一步將微波能轉換為熱能。微波具有直線傳播和遇導體（如金屬）反射的特性。同時，微波能穿透絕緣體，如塑料，不會被加熱。極性液體在微波作用下吸收微波并被加熱。微波還具有屏蔽特性，能在有效均勻的金屬間隙和網孔中屏蔽。微波消解主要利用了微波的加熱優勢和特性。特殊塑料消解罐內的待消解樣品加入酸后，形成強極性溶液。利用微波體加熱的性質，溶液內外同時被加熱，使得加熱過程更快、更均勻，提高了效率。微波消解通常在密閉高壓消解罐內進行，可以產生過熱現象，即加熱溫度高于常壓下的沸點，大大加快了消解速度，并能處理一般濕法消解難以處理的樣品。在密閉體系中進行微波消解，能夠防止揮發性元素的損失，進行一些常規濕法消解無法進行的項目。這種高效的消解技術在分析化學領域得到了廣泛應用，特別是在土壤、巖石、礦物和生物樣品的前處理中。