商鋪應有以下證件：

營業執照

這是商鋪開展經營活動的法定證件，證明商鋪的合法身份和經營資格。

稅務登記證

商鋪在進行商品銷售或提供服務時，需要繳納相應的稅款，稅務登記證是商鋪納稅的憑證。

消防合格證

商鋪在開業前需要通過消防驗收，確保商鋪的消防安全設施完備，符合相關規定，獲取消防合格證。

衛生許可證

對于涉及食品銷售或提供餐飲服務的商鋪，還需要獲得衛生許可證，以確保商鋪的衛生條件達標。

其他相關證件

根據商鋪的具體業務類型和所在地區的要求，可能還需要其他特定的證件，如環保批文、行業經營許可證等。

詳細解釋如下：

1. 營業執照：這是由工商行政管理部門頒發的證件，證明商鋪在法律允許的范圍內開展經營活動。申請營業執照時需要提交相關材料，如身份證明、租賃合同、經營場所證明等。

2. 稅務登記證：商鋪在進行經營活動時，需要履行納稅義務。稅務登記證是商鋪納稅的憑證，同時也是商鋪合法經營的重要證明。

3. 消防合格證和衛生許可證：這兩類證件是商鋪安全經營的重要保證。消防合格證確保商鋪的消防安全設施完備，衛生許可證則確保商鋪的衛生條件符合相關標準，尤其對于食品銷售和餐飲服務的商鋪更為重要。

4. 其他相關證件：不同地區、不同行業可能有特定的經營要求，商鋪需要根據實際情況辦理相應的證件，如環保批文、行業經營許可證等。這些證件的辦理有助于確保商鋪的合規經營，保障消費者的權益。

以上便是商鋪應持有的主要證件。不同商鋪在經營過程中可能還需要其他證件支持其合法運營，建議根據具體情況進行了解和辦理。