在進行肉毒毒素治療腦癱之前，必須明確治療目標并制定細致的計劃，這個過程需要神經科、矯形科和康復科等多學科的合作。治療目標不應僅限于降低痙攣，還應考慮到肌張力增高在某些情況下對患者的積極作用。治療后，應結合肌腱牽拉、運動訓練或使用矯形器具等措施，以矯正畸形并提升運動技能。評估肉毒毒素治療效果時，可以使用視頻影像分級、計算機步態分析系統等客觀可靠的技術和臨床試驗。粗大運動功能量表（GMFM）、醫師評定量表（PRS）和Asworth肌張力分級等方法也可用于評估，但可能受主觀因素影響。20世紀90年代的兩個隨機對照試驗（RCTs）通過比較肉毒毒素注射組和石膏矯形組的數據，利用視頻影像分級、計算機步態分析系統和PRS等方法，分析了在降低下肢肌源性張力、改善步態方面的差異。其中一個試驗顯示肉毒毒素組表現優于石膏矯形組，而另一個試驗未發現顯著療效差異。2000年，Koman等人通過設立注射組和安慰劑對照組（RCT）觀察了腦癱患兒腓腸肌注射后的步態變化，結果顯示注射組明顯優于安慰劑組。Desloovere等人研究認為，肉毒毒素注射結合石膏矯形能更有效地改善步態。關于肉毒毒素治療腦癱患兒上肢肌痙攣的報道較少。1997年，Corry等人觀察到注射后上肢肌緊張程度降低，某些功能得到改善，但肌力下降影響了手的精細抓握能力。他們認為療效結果在試驗對象中存在很大差異，并強調由于上肢需要更高的精細協調運動，在治療上肢時應更謹慎地選擇患者并進行療效評估。總體而言，肉毒毒素注射在降低痙攣、減輕護理難度、矯正蹲伏步態和剪刀步等方面顯示出益處，但在改善功能方面的優勢不明顯。