在游戲過程中，可以中斷或結束模擬宇宙運行進程。如選擇「結束并退出」將直接結算獎勵。如選擇「保存并退出」將保存進度，在通關后保存則會保存本次模擬宇宙獲得的所有祝福，以供挑戰模式使用。「模擬宇宙」是一個獨立的虛擬空間，將以代碼的形式隨機生成虛擬的敵人與地圖，擊敗敵人后能夠獲得虛擬星神的「祝福」，每次可從多個祝福選擇其一，即可得到不同的增益效果。戰斗前后可通過「下載裝置」下載角色代碼，選擇已擁有的角色，與角色一同踏上充滿未知的虛擬之旅。獲得更多祝福，就可以讓隊伍越來越強。同時，模擬宇宙分為兩個模式：探索模式與挑戰模式。跟隨開拓任務指引，在體驗一次模擬宇宙之后，將開啟探索模式。挑戰模式則需要通關一次探索模式，并留下對應存檔，方可挑戰強敵。挑戰模式中，將使用通關探索模式的隊伍及祝福對抗強敵，強敵在戰斗中損失的生命值將決定分數高低。同時挑戰模式有獨立的挑戰目標，完成愈多挑戰目標則分數越高。