1、通道是：利用Miltenyi或其他公司的磁珠對目的細胞做預純化或清洗可提高分揀效率。當然，僅僅利用一輪或多輪磁珠篩選而不用流式細胞儀，許多研究也能開展起來，但這不是本文討論的重點。Amnis 公司已將流式細胞儀射流與熒光顯微鏡和數字成像整合在一起。其結果是一系列單個細胞的圖像能夠顯示熒光團的分布，而非簡單的平均熒光指數（MFI）。

2、目前有33種不同的金屬可被同時檢測。該儀器被Time of Flight 稱為"Cytof" [1] 。考慮購買該儀器的研究人員應該確保他們有這一深度的細胞分析需要。此外，細胞在等離子體中會被汽化，所以用于研究的細胞不能恢復。蒸汽分揀儀硬件設備簡單，檢測點與收集裝置間距離較短，檢測樣品的激光數多。而流動細胞分揀系統通過比色皿提供層流和增強的樣品聚焦。

3、然而，流動細胞長度有限，而且激光光學裝置需要足夠空間避免不同通道間的串擾。對于敏感性來說，流動細胞系統明顯占優，但蒸汽系統沒有保持細胞清潔的問題，并且能提供額外的激光束。需要指出的是，有些激光束本身對細胞有毒害作用。