基于結構的藥物設計的思路是這樣的,對于任何一種酶來說,它能起作用的催化功能都是與其自身的三維立體結構相對應的。打個比方的話,一種酶和它的作用底物有點像鑰匙和鎖的關系。酶分子就像一把鎖,只有特定性狀的作用底物(也就是鑰匙)才能插得進去并且轉動鎖,從而發揮功能。
?
我們知道,鎖和鑰匙需要配對才能開鎖。相似的,一個酶分子(綠色)和鎖一樣,也具備某種的構象,只能特異地識別某種底物分子(紫色),兩者精確結合才能激活酶的功能。在DPP-4的故事里,DPP-4就像一把鎖一樣特異地識別GLP-1分子的形態,并切割GLP-1一端的氨基酸。不過要提醒讀者們注意的是,鎖與鑰匙模型僅僅是對酶分子功能的粗淺解釋,酶的反應動力學要復雜得多。比如,和鎖不同的是,酶分子的構象會根據底物的不同而發生可塑的變化。