果樹原有優良種性減弱的現象稱之為果樹品種的退化變劣。其主要表現為同品種各個單株間產量發生變異，形態特征出現畸變等。果樹品種退化變劣的主要原因如下：

1、基因劣質微突變的積累

果樹突變的頻率依樹種、品種、樹齡而異，但在多數情況下，劣變多于優變。

果樹大部分以微突變的形式出現，其形態表現在外觀上不易區分，繁育時易將劣變材料混入，引起種性退化。

2、繁殖材料的異質性

健壯毒枝和徒長枝，接穗各段芽的異質性均可形成殖體個體間的微細差異。

因此，必須選擇充實健壯的枝芽作接穗。衰老的芽條在生理上趨于衰退，細胞的生理活性降低，更新能力減弱，其后代較易引起退化。

3、某些果樹病毒的侵染

受病毒、類菌原體浸染的組織或細胞、破壞了生理協調，影響產量與質量以及引起細胞內某些遺傳物質的變異、防止退化的措施，應該對繁殖材料選優去劣和加強對種苗的檢疫，使用無病毒苗木。