要解決16位程序占用過多系統資源導致的文件過多問題，您可以按照以下步驟操作：

1.首先，打開系統設置。在桌面找到"開始"菜單，選擇"運行"，鍵入"gpedit.msc"后回車。

2.在組策略編輯器中，找到并展開"計算機配置">"管理模板">"Windows組件">"應用程序兼容性"。在此菜單下，找到"防止訪問16位應用程序"選項。

3.點擊該選項，確保已設置為"已啟用"，然后點擊"確定"保存設置。這樣可以限制部分16位程序的運行。

4.接著，再次打開"運行"，輸入"regedit"，然后確認進入注冊表編輯器。

5.在注冊表中定位到"HKEY_LOCAL_MACHINESYSTEMCurrentControlSetControlWOW"，右鍵選擇"新建"，然后創建一個DWORD值。

6.將新創建的鍵命名為"DisallowedPolicyDefault"，雙擊打開它，將數值數據設置為1。保存更改后，該設置將有助于進一步限制16位程序的資源消耗。

通過以上步驟，您可以限制部分16位程序的運行，并減少它們對系統資源的占用，從而改善系統的整體性能。如果問題依然存在，您可能需要考慮逐步退出那些占用過多資源的16位程序。