結論是，初中階段確實需要辦理《預防接種證》。根據國家的《疫苗流通和預防接種管理條例》，該證件是兒童入托、入學時必須提供的必要文件。條例明確規定，托幼機構和學校在接收學生時，會進行預防接種證的查驗，以確保孩子們按照國家免疫規劃接種了相應的疫苗。對于未完成疫苗接種的兒童，學校需向相關疾病預防控制機構報告，并協助其監護人盡快補種。

國家免疫規劃由國務院衛生主管部門制定，根據全國傳染病流行情況和人群免疫狀況等因素來確定疫苗種類。國務院財政部門會參與決策，疫苗種類經國務院批準后公布。省級政府在執行國家免疫規劃時，可根據本地實際情況增加免費疫苗種類，但需報國務院備案。

我國實行有計劃的預防接種制度，尤其是對于未成年人，監護人需配合醫療機構確保其及時接種第一類疫苗。因此，無論是幼兒園、小學還是初中，辦理《預防接種證》都是為了保障孩子們的健康和教育權益，是法定的要求。