倭瓜和南瓜雖然都屬于葫蘆科南瓜屬的植物，但它們之間存在著一些區別。南瓜，學名CucurbitamoschataDuchesne，又名番瓜、北瓜，原產于墨西哥和中美洲地區，由于其廣泛的栽培，已經成為全球熟知的作物。南瓜的果實用途廣泛，既可作為食材烹飪，也可充作糧食，同時全株部還可用于藥用。南瓜是一年生蔓生草本植物，莖可分節生根，葉片寬卵形或卵圓形，質地柔軟，葉脈隆起，卷須粗壯。南瓜是雌雄同株，果梗粗壯，果實形狀多樣，有棱和槽，有的品種有縱溝，種子則呈長卵形或長圓形。南瓜的名稱有時會根據產地和品種不同有所差異，如在臺灣被稱為金瓜，而西葫蘆則是美洲南瓜的別稱。

倭瓜，又稱北方的南瓜，雖然也屬于南瓜屬，但與傳統的南瓜種類有所不同。南瓜的種類還包括筍瓜和印度南瓜等，顏色上則有橙色、橙紅色、黃色、白色和雙色混合等多種。南瓜果實形狀各異，如圓、扁圓、長圓或葫蘆形，表面光滑或有突起，成熟時會有白霜。種子通常是灰白色或茶褐色，邊緣粗糙，果肉厚實，味道香甜。南瓜嫩果可作為夏季秋季的蔬菜，口感甘美，老熟后則可用于飼料或代糖，部分地區稱其為“飯瓜”。南瓜的種子也可食用或入藥，其莖蔓能爬蔓，橫斷面呈五角形，葉子心臟形，花色為黃色，果實成熟時呈赤褐色，用途十分多樣。