在回遷房進行過戶時，首先需支付測繪費，費用為1.36元每平方米。如果回遷得到的房屋面積超過拆遷前的面積，且棕樓土地未繳納土地出讓金，則需額外支付超出面積的配套費，每平方米21.5元至35元。此外，如果面積超出部分較大，還需繳納契稅，契稅的稅率根據售樓價格的不同，買方需繳納3%。登記費用為80元，工本費同樣是80元。如果回遷房之后再次交易，其過戶流程與普通商品房相同，需支付多項費用。具體而言，測繪費同樣為1.36元每平方米，由買方承擔。評估費按評估額的0.5%收取，且允許有一定浮動，同樣由買方承擔。契稅根據房屋面積和是否為首次購房，首次購房且面積在90平方米以內的，稅率為1%；90至144平方米之間的，稅率為1.5%；超過144平方米或非首次購房，稅率為3%，這些費用同樣由買方承擔。在交易過程中，如果房屋轉讓，所得稅需由賣方承擔，按差額的20%計算。但若房屋滿5年且為唯一住房，則可免征。交易費為每平方米6元，由買賣雙方共同承擔。工本費80元，其中包含工本印花稅5元，由買方承擔。最后，如果房屋出售，賣方需繳納營業稅，稅率為5.55%，同樣在房屋滿5年的情況下可享受減免。