南京21路公交從鳳臺南路到南京西站的首班車是在清晨4點40分，而末班車則是在晚上22點10分離開。這條線路覆蓋了多個重要站點，包括鳳臺南路、賽虹橋、銀橋市場、鳳臺路集慶門、鳳臺路水西門、虎踞南路水西門、虎踞南路建鄴路、虎踞南路漢中門虎踞路漢中門、虎踞路清涼山、國防園、虎踞路草場門、虎踞北路草場門、古林公園、古平崗、鎮江路、丁山賓館、雙門樓賓館、鹽倉橋、大橋飯店、興中門以及靜海寺紀念館，直至南京西站。另外，南京21路公交從南京西站到公交車輛廠的運營時間也有不同，首班車從南京西站出發的時間是5點30分，而末班車則在晚上23點00分離開。這條線路同樣經過多個關鍵站點，如南京西站、雙門樓賓館、鹽倉橋、大橋飯店、興中門、靜海寺紀念館、虎踞北路草場門、虎踞路草場門、國防園、虎踞路清涼山、虎踞南路漢中門虎踞路漢中門、虎踞南路建鄴路、虎踞南路水西門、鳳臺路水西門、銀橋市場、賽虹橋以及鳳臺南路。