在處理上海外資企業股權轉讓時，需要依次完成一系列手續，包括商務局的變更股權轉讓，國地稅的稅源監控，外管局的資本項目處理，工商局的變更登記，稅務局的信息變更，財政局的調整，以及海關的相應變更。這些步驟需逐一完成，確保整個過程的合法性和合規性。外資企業終止的方式多樣，企業可以選擇主動自行清算，或因被工商局處罰，被迫進行清算。若企業不清算，債權人可以依據《公司法》第184條，向法院申請指定清算。此外，如果企業停止經營，投資人或管理人員撤離，可以通過股權轉讓的方式退出，實現投資回收，同時轉移投資義務和全部債權債務。在極端情況下，企業還可以選擇通過變賣資產回收投資，隨后進行清算或非法撤離。在處理外資企業終止的相關事宜時，必須遵循《中華人民共和國中外合資經營企業法》及其實施條例，以及《中華人民共和國中外合作經營企業法》及其實施細則，還有《中華人民共和國外資企業法》及其實施細則，以及《外商投資企業投資者股權變更的若干規定》（外經貿部、國家工商局[1997]外經貿法發第267號）。這些法律法規為處理外資企業的終止提供了明確的指導和依據。其他相關的法律和法規同樣適用于外資企業的終止和股權轉讓流程，確保整個過程的合法性與規范性。