醫療保險關系轉移涉及兩個方面：一是不同統籌地區的醫療保險繳費年限和個人賬戶余額轉移；二是不同險種之間的繳費年限轉移。在不同統籌地區之間轉移醫療保險關系時，首先，參保人員需向原統籌地區的醫療保險經辦機構申請開具參保憑證，提供居民身份證等必要證件。之后，參保人員或其新就業單位應向新的統籌地區醫療保險經辦機構提出轉入申請，同樣需要提供參保憑證和相關證明材料，填寫《基本醫療保險關系轉移接續申請表》。接下來，轉入地醫療保險經辦機構會將申請信息反饋給轉出地醫療保險經辦機構，后者收到《基本醫療保險關系轉移接續聯系函》后，會向轉入地劃轉參保人的醫療保險個人賬戶余額，同時完成醫療保險繳費年限的轉移。對于不同險種之間的醫療保險關系轉移，城鎮居民基本醫療保險或新型農村合作醫療的參保年限可以折算為城鎮職工基本醫療保險的繳費年限，每一年的參保年限可折算為四個月的繳費年限。但是，這種轉移和折算的年限不能用來抵消靈活就業人員在參加城鎮職工醫療保險時所需的“靈活就業人員醫療待遇等待期”，即靈活就業人員需連續繳納城鎮職工醫療保險一年后才能享受統籌待遇。