工程履約保函的有效期限一般不超過工程竣工驗收后的三個月。具體的有效期根據工程合同中的約定來確定，建議在合同中明確雙方協商后的具體期限。

工程履約保函是為了確保工程合同的履行而設立的一種擔保方式。其有效期限的設置是為了保障工程項目在實施過程中，承包商按照合同約定履行其義務，直至工程竣工驗收并完成相關后續工作。因此，履約保函的有效期限通常與工程進度、驗收及后續工作的時間節點緊密相關。

在工程實踐中，履約保函的有效期限通常會根據工程項目的具體情況進行設定。比如一些工期較長、技術要求較高的工程項目，履約保函的有效期限可能會相對較長。而對于一些工期較短、技術相對簡單的工程項目，履約保函的有效期限則可能會相對較短。此外，合同中約定的具體期限還會受到相關法律法規的制約，因此在實際操作中還需結合法律進行約定。總之，履約保函的有效期限是根據工程實際情況而定的，旨在確保工程合同的順利履行及雙方的合法權益得到保障。

為了保證合同的履行及后續工作的順利進行，工程雙方在簽訂合同及履約過程中需密切合作并加強溝通，確保履約保函的相關條款得到有效執行。同時，在合同中也應明確雙方的權利和義務，以便在出現爭議時能夠及時解決并維護雙方的合法權益。