蒽醌類化合物根據其母核結構的不同，可分為單蒽核和雙蒽核兩大類。在單蒽核類中，又細分為多種類型，包括蒽醌及其苷類、氧化蒽酚衍生物、蒽酚或蒽酮衍生物以及C-糖基余肆蒽衍生物。1. 蒽醌及其苷類是天然蒽醌的主要形式，以9,10-蒽醌最為常見。這類化合物在中藥中廣泛存在，如大黃和虎杖，它們的活性成分屬于大黃素型羥基蒽醌衍生物。這些化合物可能與葡萄糖、鼠李糖等糖類分子結合形成苷。2. 氧化蒽酚衍生物是蒽醌在堿性條件下被還原生成的不穩定產物，容易進一步氧化成蒽酮或蒽酚。3. 蒽酚或蒽酮衍生物是蒽酮在酸性條件下被還原或氧化生成的化合物。新鮮大黃中存在蒽酚類成分，但貯存兩年以上后，這些成分難以檢測到。4. C-糖基余肆蒽衍生物是糖類側鏈通過碳-碳鍵與蒽核直接相連的化合物。在雙蒽核類中，包括二蒽酮類衍生物、二蒽醌以及去氫二蒽酮類。1. 二蒽酮類衍生物是由兩個蒽酮分子脫氫縮合而成的化合物，結構對稱。它們多以苷的形式存在，如中藥大黃和番瀉葉中的主要成分番瀉苷A、B、C、D。2. 二蒽醌類是由兩個蒽醌環通過共價鍵連接而成的化合物，結構對稱，呈現特殊的紫紅色。3. 去氫二蒽酮類是二蒽酮類進一步氧化的產物，兩個蒽環之間以雙鍵相連，顏色更深，呈紫紅色。以上各類蒽醌化合物在自然界中廣泛存在，并在中藥中發揮著重要的藥理作用。