對于沒有發票而只有支票根的情況，可以首先進行應付賬款的入賬處理。確保銀行存款賬戶的準確性是非常重要的，這樣可以避免后續的財務問題。接下來，積極向供應商索要發票，這是非常必要的步驟。如果對方不能提供發票，可以向老板解釋情況，說明沒有發票入賬需要繳納所得稅的問題。與老板溝通時，可以詳細說明具體原因，比如對方因故未能及時提供發票等，爭取理解和支持。同時，可以提出一些解決方案，比如在一定時間內補交發票，或采取其他方式證明支出的真實性。另外，如果涉及長期合作的供應商，可以考慮簽訂合同，明確發票提供的時間期限，以減少此類問題的發生。此外，企業應建立完善的財務管理流程，確保所有支付都及時獲得相應的發票。可以考慮使用電子發票系統，這樣可以提高發票獲取的效率和準確性。對于一些小額支出，如果確實無法獲得發票，可以考慮通過內部審批流程，確保這些支出的真實性和合理性。總之，面對沒有發票而只有支票根的情況，需要采取積極措施，既要解決當前的問題，也要防止類似問題再次發生。通過有效的溝通和管理，可以順利解決問題，確保企業的財務健康。