是的，甘肅公航旅和甘肅高管局合并了。

詳細解釋如下：

甘肅公航旅和甘肅高管局經過一系列整合措施，最終實現了合并。這一舉措是為了更好地整合甘肅省的交通運輸資源，提高管理效率和服務水平。甘肅公航旅主要負責公路、航空、旅游等領域的投資和運營，而甘肅高管局則負責高速公路的管理和運營。兩者的合并可以更好地協調交通運輸資源，推動甘肅省交通運輸事業的發展。

這一合并舉措的實施，旨在優化甘肅省的交通產業布局，促進交通與旅游、航空等產業的深度融合。合并后，新的機構將承擔起甘肅省內交通基礎設施建設、運營和管理的重要任務，為甘肅省的經濟社會發展提供更加便捷、高效的交通服務。

甘肅公航旅和甘肅高管局的合并，標志著甘肅省在交通運輸領域的改革取得了重要進展。這一改革將有助于提升甘肅省的交通綜合實力，為甘肅省的經濟社會發展提供更加有力的支撐。合并后的新機構將繼續致力于提高服務質量，推動甘肅省交通運輸事業的持續健康發展。