蘿卜入窖的時間宜在清晨或下午天氣較涼時進行，防止高溫條件下入窖。埋藏時，蘿卜根部朝上，頂部朝下，斜靠坑壁，一個緊挨一個按同樣順序碼地坑里。這種放置方法有抑制蘿卜抽薹發芽、減少糠心的作用。待全坑放滿一層后，在上面撒一層厚約5厘米的濕潤土。再碼第二層，碼完后又撒濕潤的土，然后碼第三層，一般可以擺3-4層，使溝內蘿卜的高度在60-80厘米，最上一層蘿卜的上面，覆濕潤的細土10厘米左右。隔層用的土，以用挖坑時下層的土為宜。因為這些土在耕作層以下，沒有病蟲害。隨著氣溫下降再分次覆土，每次覆土均應在強寒流到來之前。第二次覆土大約在11月底，第三次覆土大約在12月中旬，第三次覆土總厚約30-50厘米。只要蘿卜質量好，入窖前未受熱、凍害，可以安全貯藏到翌年3-5月。如果冬季要取食或上市供應，在覆土達20厘米時，可在上面蓋20-30厘米厚的玉米秸或其它防寒覆蓋物，使溝窖覆土微凍或不凍，以便于挖窖。　　在我國東北、西北高寒地區，冬季土壤凍層很深，貯藏蘿卜不宜用溝窖埋藏，而應用地下式菜窖，或用恒溫庫貯藏。地下式菜窖是在地下水位較低、背風向陽處建造的。窖深2米，寬5-6米，長10-20米，成長方形。窖頂部架橫梁蓬頂，底層鋪50-80厘米厚的玉米秸，上面蓋100厘米厚的土。整個窖頂厚度略少于當地冬季凍土層的厚度。入口設在窖頂部，上下利用梯子。這種地下式菜窖冬季可保持0-2℃的氣溫，蘿卜不致受凍害。由于窖內空氣濕度很大，蘿卜只需排列成行垛放即可，不用覆土。恒溫庫是目前最先進的貯藏蔬菜的場所。庫內可自動調節溫、濕度，貯藏蘿卜十分保險。