黃鱔體細長圓柱狀呈蛇形，體長約20-70厘米，最長可達1米。體前圓后部側扁，尾尖細。頭部膨大長而圓，頰部隆起。口大，端位，吻短而扁平；口開於吻端，斜裂；上頜稍突出，唇頗發達。上下頜及口蓋骨上都有細齒。眼甚小，隱於皮下，為一薄皮所覆蓋。鰓裂在腹側，左右鰓孔于腹面合而為一，呈倒“V”字形。鰓膜連于鰓峽。鰓常退化由口咽腔及腸代行呼吸。無魚鰾這類輔助呼吸的構造，而是由腹部的一個鰓孔，口腔內壁表皮與腸道來掌管呼吸，能直接自空氣中呼吸。[1]?

體裸露潤滑無鱗片，富黏液；無胸鰭和腹鰭，背鰭和臀鰭退化僅留皮褶，無軟刺，都與尾鰭相聯合。生活時體呈黃褐色，側線完全，沿體側中央直走。體背為黃褐色，腹部顏色較淡，全身具不規則黑色斑點紋，黃鱔的體色常隨棲居的環境而不同。體鰻形，鰭無棘，背鰭、臀鰭延長，與尾鰭相連，無腹鰭，或者小如存在為喉位。[1]?