在使用餓了么外賣時，超時賠付的處理方式取決于不同的責任方。如果商家在接單后未按時發貨，超時責任主要由商家承擔。然而，如果商家已經將訂單交付給配送員，但配送員的延遲導致了超時，配送員將負責賠付。在這種情況下，如果配送員拒絕賠償，餓了么外賣平臺會先行賠付，隨后從配送員的賬戶中扣除相應的費用。

通常，超時賠付的款項會在一個工作日內直接返還到用戶的餓了么賬戶余額，用戶可以自行檢查是否有到賬。餓了么還提供了“準時保”服務選項，用戶在支付時選擇該服務并支付訂單總價2%至3%的服務費，就能享受額外的保障。一旦外賣送達時間超過預計時間10至15分鐘，最低可獲得訂單實付金額的20%作為賠償。例如，30元的訂單，最低可以獲得6元的賠償。如果延誤超過30分鐘，賠付金額可達訂單實付的100%，相當于為用戶免單。所有賠付款會通過線上方式直接退回到用戶的餓了么賬戶余額中。