1966-67賽季，拜仁慕尼黑在德甲聯賽中名列第三，但贏得了德國杯冠軍，獲得了參加下賽季歐洲優勝者杯的資格。在1967年的歐洲優勝者杯決賽中，憑借弗朗茨·羅特的加時賽進球，拜仁以1比0擊敗了蘇格蘭的格拉斯哥流浪者，贏得了冠軍。1968年，南斯拉夫人布蘭科·澤比奇成為了拜仁的主教練，他以嚴格的紀律要求著稱，帶領球隊取得了輝煌的成績。澤比奇僅用13名球員，便帶領拜仁贏得了德國足球歷史上首個德甲聯賽和德國杯雙冠王。從1970-71賽季起，烏多·拉特克開始執教拜仁。在拉特克的首個賽季，拜仁贏得了德國杯冠軍。1971-72賽季，拉特克帶領拜仁獲得了德甲冠軍，這是球隊歷史上第三次贏得這項榮譽。在對陣沙爾克04的關鍵比賽中，拜仁5比1大勝對手，在慕尼黑奧林匹克體育場進行了德甲歷史上首次直播比賽，創下多項歷史記錄。接下來的兩年，拜仁實現了德甲三連冠的偉業。1974年歐洲冠軍杯決賽的重賽中，拜仁以4比0擊敗馬德里競技，再次捧杯。然而，拜仁在國內聯賽的表現并不理想，僅在1975年歐洲冠軍杯決賽中擊敗利茲聯，捍衛了自己在歐洲的地位。次年的歐洲冠軍杯決賽，拜仁以3比1戰勝法國球隊圣埃蒂安，實現歐洲賽場連續三年的輝煌。同年，拜仁還贏得了豐田杯冠軍。然而，在接下來的幾年里，拜仁再未贏得任何重要比賽的冠軍，弗朗茨·貝肯鮑爾也遠赴紐約宇宙隊。1979年，塞普·邁耶和烏利·赫內斯宣布退役，蓋德·穆勒則加盟了勞德代爾。