為了核算和監督基本建設預算撥款的撥入、使用、上交和結余等情況，建設單位通常需要設置一系列會計科目。這些科目主要用于記錄和追蹤各項資金的流動情況，確保財務的透明和準確。“基建撥款——本年預算撥款”科目屬于資金來源類科目，主要用于記錄本年內由地方預算撥入的基本建設撥款。貸方登記收到上級撥入的撥款限額，退回和年終注銷的撥款限額（用紅字登記），以及年初建立新賬時的結轉上年度“預收下年度預算撥款”。借方平時一般不登記；期末貸方余額反映本年預算撥款限額的實際撥入數。“基建撥款——預收下年度預算撥款”科目主要用于記錄建設單位本年內收到預算撥入的下年度基本建設撥款。貸方登記收到財政部門預撥的下年度基本建設預算撥款限額，借方平時不登記；期末貸方余額反映下年度預算撥款限額的實際數額。“基建撥款——本年交回結余資金”科目主要用于核算本年內按投資隸屬關系上交財政或主管部門的基本建設結余資金。借方登記按投資隸屬關系實際上交的基本建設結余資金；貸方平時不登記；期末借方余額反映實際上交結余資金的累計數。“基建撥款——以前年度撥款”科目主要用于核算以前年度撥入而尚未沖轉的各項基本建設撥款。貸方登記年初建立新賬時結轉“基建撥款”科目所屬其他明細科目的上年末貸方余額；借方登記年初建立新賬時結轉“基建撥款”科目所屬有關明細科目的上年末借方余額，“交付使用資產”科目的上年末借方余額（用基建撥款完成的部分），以及年終決算經財政部門審核批準后，調整批準數大于已沖銷數的差額。“限額存款”科目屬于資金占用類科目，主要用于核算建設單位收到上級撥入存在建設銀行撥款賬戶內的基本建設投資撥款限額。包括基本建設預算撥款限額和基本建設基金撥款限額。借方登記收到上級撥入的撥款限額，退回和年終注銷的撥款限額（用紅字登記）；貸方登記支用的撥款限額；期末借方余額反映尚未支用的撥款限額。建設單位應設置“限額存款日記賬”，根據撥款限額通知，以及收款憑證和付款憑證，按照經濟業務發生的先后順序，逐筆登記。在建設銀行同時開設幾個撥款戶的建設單位，應按各撥款戶分別設置“限額存款日記賬”，進行序時核算。