試管嬰兒和自然懷孕在并發癥方面，比如流產、宮外孕、畸胎、死胎等的發生幾率相近。盡管試管嬰兒的多胎率較高，早產率也有所增加，這主要與多胎及母親年齡較大有關。具體數據如下：流產率約為14-30%，略高于自然懷孕的15-20%；宮外孕率約為2-5.8%，與自然懷孕的3-5%相近；早產率約為24-30%，遠高于自然懷孕的6-7%；新生兒體重偏輕的概率也較高，約為27-32%，而自然懷孕僅為5-7%；死嬰率則為1.2%，與自然懷孕的0.6%相近；新生兒死亡率約為2.7%，也高于自然懷孕的1.0%；畸形率約為0.8-5.4%，和自然懷孕的0.8-4.5%相近；剖腹產率則高達33-58%，遠高于自然懷孕的10-25%。人們往往誤認為試管嬰兒和其他孩子有所不同，但實際上這種觀點是錯誤的。首先，試管嬰兒是夫妻親生子女，治療對象必須是夫妻，所取的精子和卵子均來自夫妻雙方，因此孩子肯定是親生的。其次，試管嬰兒并非在試管中長大，僅是受精卵在體外培養2-3天，形成胚胎后移植回母體子宮，繼續發育成為胎兒，同樣經歷十月懷胎直至分娩。最后，對于試管嬰兒健康問題的擔憂完全沒有必要，試管嬰兒與普通嬰兒并無區別，同樣可以擁有健康的身體和聰明的大腦。綜上所述，試管嬰兒和自然懷孕在并發癥和出生率方面存在差異，但這些差異主要是由多胎率和母親年齡較大引起。試管嬰兒在其他方面與自然懷孕的嬰兒沒有顯著差異，可以擁有健康的身體和聰明的大腦。