根據(jù)《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)土地增值稅清算管理有關(guān)問題的通知》（國(guó)稅發(fā)[2006]187號(hào)）的規(guī)定，當(dāng)房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)將開發(fā)的部分房產(chǎn)轉(zhuǎn)為企業(yè)自用或用于出租等商業(yè)用途時(shí)，如果產(chǎn)權(quán)未發(fā)生轉(zhuǎn)移，則不征收土地增值稅，在稅款清算時(shí)不列收入，也不扣除相應(yīng)的成本和費(fèi)用。這意味著，如果房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)將開發(fā)的商品房部分轉(zhuǎn)為自用辦公，該辦公自用的房產(chǎn)的成本費(fèi)用在土地增值稅清算時(shí)不能被扣除。這一規(guī)定明確了土地增值稅清算時(shí)的處理方式，對(duì)于企業(yè)合理規(guī)劃和成本控制具有重要意義。值得注意的是，即便企業(yè)將開發(fā)的房產(chǎn)轉(zhuǎn)為自用辦公，但若未發(fā)生產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移，則在土地增值稅清算時(shí)不被視為出售行為，因此不會(huì)影響到土地增值稅的計(jì)算。因此，企業(yè)在進(jìn)行土地增值稅清算時(shí)，需嚴(yán)格遵守相關(guān)稅務(wù)規(guī)定，確保合規(guī)操作。此外，企業(yè)應(yīng)關(guān)注稅務(wù)政策的變化，及時(shí)調(diào)整經(jīng)營(yíng)策略，以降低稅務(wù)風(fēng)險(xiǎn)，提高經(jīng)濟(jì)效益。同時(shí)，企業(yè)還應(yīng)加強(qiáng)財(cái)務(wù)管理，確保成本費(fèi)用的真實(shí)性和準(zhǔn)確性，以便在土地增值稅清算時(shí)提供充分的證明材料。綜上所述，對(duì)于房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)而言，將開發(fā)的商品房轉(zhuǎn)為自用辦公，其成本費(fèi)用在土地增值稅清算時(shí)是不能被扣除的。這一規(guī)定有助于規(guī)范房地產(chǎn)市場(chǎng)的健康發(fā)展，維護(hù)稅收公平。