細菌是一種原核型細胞，單胞生物，體積微小，結構簡單。它們沒有成形的細胞核和核仁，也沒有核膜，除核蛋白體外無其他細胞器。真菌的細胞則具有真正的細胞核，能夠產生孢子。真菌體內缺乏葉綠素，它們通過分解和吸收外界有機物來獲取營養。霉菌是真菌的一種，由分枝菌絲構成，雖然在分類上屬于真菌門的各個亞門，但并不作為分類學的名詞。支原體是一種介于細菌和病毒之間的原核細胞，大小介于細菌和病毒之間，結構簡單，多數呈球形，沒有細胞壁，僅由三層細胞膜構成。衣原體是一類嚴格的真核細胞胞內寄生原核細胞微生物，具有獨特的發育周期，能通過細菌濾器，對粘膜表面的柱狀上皮有嗜性。過去衣原體被認為是病毒，現在歸屬于廣義細菌中的一類微生物。病毒是介于生命與非生命之間的一種物質形式，存在環境之中，當游離于細胞之外時，不能復制，不表現生命形式，只以有機物的形式存在。但一旦進入細胞，它就能控制細胞，使其按照病毒的生命活動需要運作，表現出生命形式。病毒由一個或幾個核酸分子組成的基因組，有一層蛋白或脂蛋白保護性外殼，且能在特定宿主細胞中自我復制。除了上述微生物，還有其他致病微生物，如寄生蟲、立克次體、螺旋體和放線菌。寄生蟲是一種寄居在宿主體內或體外的一類生物，利用宿主作為食物來源和生長繁殖的場所，可能導致寄生蟲病，給宿主帶來危害，甚至致死。立克次體是一種介于最小細菌和病毒之間的獨特微生物，具有多形性，可以是球桿狀或桿狀，有時呈現長絲狀體。立克次體的大小約為0.3微米至0.8微米，寬度0.3微米至0.5微米，絲狀體長度可達2微米。一般可在光學顯微鏡下觀察到。螺旋體是一種細長、柔軟、彎曲呈螺旋狀的運動活潑的單細胞原核生物，全長3～500微米，具有細菌細胞的所有內部結構。放線菌是原核生物的一個類群，大多數具有發達的分枝菌絲。菌絲纖細，寬度接近于桿狀細菌，約0.5～1微米。