少兒醫保報銷比例主要分為以下幾種情況：1、一級醫院(社區衛生服務中心)不設起付線，報銷65%;2、二級醫院起付線為300元，報銷60%;3、三級醫院起付線500元，報銷55%。一、醫保報銷申請流程：1、少兒申報：少兒醫保網上申報系統-->點我進入；大學生申報：大學生醫保網上申報系統-->點我進入；2、到社保局窗口提交申請材料(學校在冊少兒則父母把材料提交給學校，由學校提交給社保局，大學生則把身份證及銀行卡復印件提交給學校即可)：（1)《深圳市少年兒童參加住院醫療保險信息登記表》；（2)少兒的身份證原件或戶口本復印件(驗原件)；（3)監護人的戶口本原件，如監護人是軍人的，驗軍人的軍官證且受理復印件及駐深部隊證明；（4)驗證明少兒與監護人之間關系的有效證件；（5)參保人或監護人的銀行存折原件且提供復印件；（6)新生兒還需提供出生證明及母親身份證復印件(驗原件)；（7)非深戶還需提供深圳市計生部門開具的生育證明原件；二、辦理醫療保險需要辦理的材料：1、參保人有效身份證件；2、若委托他人辦理，還需提供被委托人有效身份證件；3、單位批量新增制卡的，被委托人還需攜帶單位介紹信，不需提供參保人身份證件。法律依據《中華人民共和國社會保險法》第二十三條職工應當參加職工基本醫療保險，由用人單位和職工按照國家規定共同繳納基本醫療保險費。無雇工的個體工商戶、未在用人單位參加職工基本醫療保險的非全日制從業人員以及其他靈活就業人員可以參加職工基本醫療保險，由個人按照國家規定繳納基本醫療保險費。