摩托車協議過戶被交警查是會被扣的。摩托車協議過戶會不會被交警扣車與以下幾種情況有關：1.摩托車駕駛人有沒有攜帶駕駛證2.有沒有繳納機動車交強險3.有沒有盜搶嫌疑4.是不是拼裝車和有沒有達到報廢標準等有關。就一般來說，協議過戶的摩托車是因為買賣雙方無法變更摩托車駕駛證、牌照和登記證書等信息，從而涉嫌違反道路交通安全法，被交警查住后會被扣留。一些人為了省事和便宜，從網上或者二手車買賣渠道購買了摩托車，這種摩托車并沒有在當地交管所或者異地交管所辦理二手車轉讓過戶手續，只是買賣雙方簽訂了過戶手續，看似合理，實則不合法。一旦駕駛這樣的摩托車上路的話，只要被交警查到，是很容易被扣車的。一般來說，摩托車如果是協議過戶的話，交強險是需要摩托車所有人到當地車管所繳納的，如果買主能找到賣主，由賣主辦理相關手續，不會影響年審，但是如果聯系不到賣主將無法過年審，騎著這樣的摩托車上路，是會被交警扣車和罰款的。法律依據《中華人民共和國民法典》第一千二百一十條 當事人之間已經以買賣或者其他方式轉讓并交付機動車但是未辦理登記，發生交通事故造成損害，屬于該機動車一方責任的，由受讓人承擔賠償責任。《二手車流通管理辦法》第十九條　二手車交易完成后，賣方應當及時向買方交付車輛、號牌及車輛法定證明、憑證。車輛法定證明、憑證主要包括：（一）《機動車登記證書》；（二）《機動車行駛證》；（三）有效的機動車安全技術檢驗合格標志；（四）車輛購置稅完稅證明；（五）養路費繳付憑證；（六）車船使用稅繳付憑證；（七）車輛保險單。