疫情跨區通行證的辦理流程，具體如下：1、由個人出具申請書2、申請書由申請人所在村委會主任或書記在申請書上出具審核意見并簽名，加蓋村委會公章后報指揮部交通管控組3、指揮部交通管控組審核后上報指揮部辦公室審核批準4、指揮部交通管控組發放臨時車輛通行證跨區域,從一個區到另一個區。通行證，指準許在某一特定區域通行的證件。由于各地區疫情嚴重的原因，在人員以及車輛跨區行駛時，是需要出示綠色的通行指示牌才可通行一、疫情期間辦理通行證的要求如下：1、提出申請的個人、單位以及出具審核意見的村委會、單位及行業監管部門主要負責人要實事求是、親自把關，對因弄虛作假出具審核意見導致出現不良后果的將嚴肅追究相關責任人責任2、通行證實行一車一證，必須注明車輛牌照、車輛編號、有效期限。全縣各交通管制點工作人員在辦理車輛放行時必須認真核對通行證注明的車輛牌照、通行證有效期、隨車駕駛員及其他人員信息，防止冒用通行證現象3、各鄉鎮要明確一名副鄉長作為聯絡員，具體負責各鄉鎮疫情防控期間的交通管控事宜法律依據：《中華人民共和國公民出境入境管理法》第九條　中國公民出境入境，應當依法申請辦理護照或者其他旅行證件。中國公民前往其他國家或者地區，還需要取得前往國簽證或者其他入境許可證明。但是，中國政府與其他國家政府簽訂互免簽證協議或者公安部、外交部另有規定的除外。中國公民以海員身份出境入境和在國外船舶上從事工作的，應當依法申請辦理海員證。第十條 中國公民往來內地與香港特別行政區、澳門特別行政區，中國公民往來大陸與臺灣地區，應當依法申請辦理通行證件，并遵守本法有關規定。具體管理辦法由國務院規定。第十一條 中國公民出境入境，應當向出入境邊防檢查機關交驗本人的護照或者其他旅行證件等出境入境證件，履行規定的手續，經查驗準許，方可出境入境。第十二條　中國公民有下列情形之一的，不準出境：（一）未持有效出境入境證件或者拒絕、逃避接受邊防檢查的（二）被判處刑罰尚未執行完畢或者屬于刑事案件被告人、犯罪嫌疑人的（三）有未了結的民事案件，人民法院決定不準出境的（四）因妨害國（邊）境管理受到刑事處罰或者因非法出境、非法居留、非法就業被其他國家或者地區遣返，未滿不準出境規定年限的（五）可能危害國家安全和利益，國務院有關主管部門決定不準出境的（六）法律、行政法規規定不準出境的其他情形