疫情期間被隔離的員工單位是無權扣工資。在隔離期間，實施隔離措施的人民政府應當對被隔離人員提供生活保障;被隔離人員有工作單位的，所在單位不得停止支付其隔離期間的工作報酬。隔離措施的解除，由原決定機關決定并宣布。一、在沒有背離防疫基本規定的條件下，不論是因個人原因又或是其他個別原因，被強制隔離（比如：新冠肺炎確診患者、病原攜帶者、疑似病例、密切接觸人群）從而無法正常完成工作的員工，公司是需按正常出勤狀態給員工發放疫情隔離期間的薪水。二、若是不是被強制隔離的情況，而是封鎖疫區、兩地出行管控、待家隔離等其個別原因造成的隔離，其薪資的支付怎么處理？1、隔離期可以工作。經公司與員工協商后，在隔離期可以通過電話、網絡待家工作的，公司按照正常出勤狀態發放工資。2、在隔離期間不能居家辦公，但安排了帶薪休假的。員工與企業商榷后，員工可以隔離期間提前使用帶薪假，公司需按照原來的假期規定分發工資。隔離天數超過原來規定的帶薪假期天數的，則按照上面的第三種情況支付工資。3、被隔離的期間內不能在家辦公，且公司沒有設置帶薪假的。員工未到崗時間在一個月內的，公司按簽訂的勞動合同內的相關約定條款分發薪資；大于一個工資支付周期（即一個月）的，公司則改成支付生活費。各地生活費的標準也會各不相同，河南省是不低于當地最低工資標準的80%。綜上所述疫情期間被隔離的員工單位是無權扣工資建議積極維護自己的合法權益不要被欺騙三、疫情期間用人單位可以辭退被隔離的員工嗎1、疫情期間用人單位是不可以辭退被隔離的員工。2、疫情防控期間，員工受疫情影響，企業不得解除被隔離人員勞動合同，并且新冠肺炎患者、疑似病人、密切接觸者在其隔離治療期間或醫學觀察期間，不計入職工醫療期。3、勞動合同履行期間，只有符合法定的條件和程序，即符合《勞動合同法》第三十九條、四十條、四十一條和四十二條規定，公司可以辭退員工。但對于生病正在治療期間的勞動者，在法定醫療期內，非本人具有第三十九條規定的法定過錯，不得辭退；醫療期滿，不能從事原工作，也不能從事用人單位另行安排的工作的，提前30天書面通知或者額外支付一個月工資可以辭退。疫情影響不計入職工醫療期，不能辭退被隔離的員工。法律依據：《中華人民共和國傳染病防治法》第四十一條對已經發生甲類傳染病病例的場所或者該場所內的特定區域的人員，所在地的縣級以上地方人民政府可以實施隔離措施，并同時向上一級人民政府報告；接到報告的上級人民政府應當即時作出是否批準的決定。上級人民政府作出不予批準決定的，實施隔離措施的人民政府應當立即解除隔離措施。在隔離期間，實施隔離措施的人民政府應當對被隔離人員提供生活保障；被隔離人員有工作單位的，所在單位不得停止支付其隔離期間的工作報酬。隔離措施的解除，由原決定機關決定并宣布。