在奧特曼格斗進化3中，許多角色都有獨特的觸發條件。佐菲按照初代、塞文、杰克、艾斯、泰羅的順序通關戰斗模式后出現。阿斯特拉則需要使用雷歐，在戰斗中使用ウルトラダブルフラッシャー終結對手，才能見到它。艾迪的出現條件較為復雜，包括奧特模式下完成A級以上的全任務，所有奧特曼各自完成一次戰斗模式和十大據點，但不包括黑暗迪迦、邪惡戴拿和LE GEND。玩具賽文在雷德王復活宣言和激斗！艾迪的兩關中，若評級達到A以上，就能見到。阿古茹需要使用蓋亞V2型態，在戰斗模式中完成一次通關后才會現身。JUSTICE則是在第16關第一部分中，使用COSMOS擊敗JUSTICE后才會出現。LEGEND在第16關評級為A以上時才會出現，但無法記錄。達達需要在奧特模式初始任務全部A級以上通關后，與隱藏關怪獸標本一同出現。格莫拉在奧特模式“怪獸殿下”任務中，完成評級為A以上后才出現。雷德王在奧特模式“怪獸標本”任務中，由雷德王擊敗初代后出現。貝蒙斯坦同樣在“怪獸標本”任務中，由貝蒙斯坦擊敗初代后出現。雙尾蛋在奧特模式“兩大怪獸襲擊東京”任務中，完成評級為A以上后出現。巴吉修姆在“怪獸標本”任務中，由巴吉修姆擊敗初代后出現。艾斯機器人在奧特模式“死刑！奧特五兄弟”任務中，直接使用艾斯機器人擊敗艾斯殺手后才會出現。黑暗迪迦和邪惡戴拿在奧特模式“影之繼承者”和“死斗！戴拿VS戴拿”中，評級為B以上通關后，在戰斗模式中使用時有一定幾率遇到，擊敗后出現。宇宙正義機器人在雙打模式中，使用COSMOS和JUSTICE一起通關一次后才會出現。至于技能方面，你只需要用不同的奧特曼分別玩一次戰斗模式和世界十大據點，同時完成侵略指令，這個奧特曼的技能基本上就全出來了。然后，你可以在裝備模式中裝備你最喜歡的能力。詳情