南京市內擁有眾多高等學府，其中排名居前的大學依次為南京大學、東南大學、南京農業大學、河海大學、南京師范大學、南京理工大學、南京航空航天大學、南京工業大學、中國藥科大學、南京郵電大學、南京醫科大學、南京林業大學、南京信息工程大學、南京中醫藥大學、南京財經大學、南京審計大學、南京工程學院、金陵科技學院、南京曉莊學院、江蘇第二師范學院、南京特殊教育師范學院、南京體育學院、南京藝術學院、江蘇警官學院和南京森林警察學院。南京大學作為江蘇省內頂尖學府之一，其在人文社科領域的影響力尤為顯著，尤其在歷史學、哲學、文學等領域有深厚的積淀。東南大學則在工程技術領域享有盛譽，尤其是在電力、信息與自動化技術方面。南京農業大學以農學見長，是全國農學研究的重要基地之一。河海大學則以其水利學科聞名，為國家培養了大量水利工程技術人才。南京師范大學在教育學方面有著深厚的學術積淀，培養了大批教育人才。南京理工大學以工學見長，尤其是在國防科技領域有著重要地位。南京航空航天大學則在航空航天領域有著顯著成就，培養了大量航空航天專業人才。南京工業大學在化學工程、材料科學等領域有著較強的研究實力，中國藥科大學則在藥學領域有著深厚的學術積淀，培養了大批醫藥行業人才。南京郵電大學則在通信工程領域有著顯著成就，為通信技術領域輸送了大量人才。南京醫科大學則在醫學領域有著重要貢獻，培養了大批醫學專業人才。南京林業大學以林學見長，培養了大量林業專業人才。南京信息工程大學則在氣象學、信息工程等領域有著較強的研究實力。南京中醫藥大學則在中醫藥領域有著深厚學術積淀，培養了大批中醫藥專業人才。南京財經大學則在經濟學領域有著顯著成就，培養了大批經濟學專業人才。南京審計大學則在審計學領域有著顯著成就，培養了大批審計專業人才。南京工程學院則在工程技術領域有著較強的研究實力，金陵科技學院則在工程技術領域也有一定的研究實力。南京曉莊學院則在師范教育領域有著顯著成就，江蘇第二師范學院則在師范教育領域也有一定貢獻。南京特殊教育師范學院則在特殊教育領域有著顯著成就，南京體育學院則在體育教育領域有著顯著成就，南京藝術學院則在藝術領域有著顯著成就。江蘇警官學院則在警官教育領域有著顯著成就，南京森林警察學院則在森林警察教育領域有著顯著成就。