PCR引物通常設計為與模板DNA的3'端互補，這樣引物就可以在DNA復制過程中引導DNA聚合酶從5'到3'方向合成新的DNA鏈。這種設計確保了PCR反應的定向性和產物的準確性。如果設計引物與模板DNA的5'端互補，那么PCR反應可能會無法成功進行，因為DNA聚合酶在合成新鏈時是從5'到3'方向移動的。這意味著引物需要與模板DNA的3'端配對，以便DNA聚合酶能夠從引物的3'端開始合成新的DNA鏈。在PCR過程中，引物與模板DNA的特定區(qū)域配對，從而定義了擴增片段的開始和結束位置。這使得PCR技術非常適合于特定DNA序列的檢測和復制。總結來說，為了確保PCR反應的有效性和特異性，引物應該設計為與模板DNA的3'端互補。這樣可以確保DNA聚合酶在正確的方向上合成新的DNA鏈，從而產生準確的擴增產物。