國家二級保護動物有白冠長尾雉、獼猴、穿山甲、黑熊、水獺、大靈貓、小靈貓、花面貍、林麝、紅腹角雉、鴛鴦、蘇門羚、毛冠鹿、銅雞、金雞、白鷴、鷹蛆龜、大鯢、虎紋蛙等。國家保護野生動物，是一些數量較少或已瀕臨滅絕的動物。

二級保護動物目錄

哺乳類，短尾猴、獼猴、藏酋猴、豺、黑熊、棕熊、石貂、水獺、小爪水獺、斑林貍、小靈貓、大靈貓、草原斑貓、荒漠貓、叢林貓、猞猁、兔猻、金貓、漁貓、其他鯨類、麝、河麂、馬鹿、水鹿、駝鹿、黃羊、藏原羊、鵝喉羚、鬣羚、斑羚、巖羊、盤羊、海南兔、雪兔等。

鳥綱類，角鸊鷉、赤頸鸊鷉、鵜鶘、鰹鳥、海鸕鶿、黑頸鸕鶿、黃嘴白鷺、巖鷺、海南虎斑鳽、小葦鳽、彩鸛、彩鹮、白琵鷺、黑臉琵鷺、紅胸黑雁、白額雁、天鵝、鴛鴦、其他鷹類、隼科等。

爬行類，地龜、三線閉殼龜、云南閉殼龜、凹甲陸龜、蠵龜、綠海龜、玳瑁、太平洋麗龜、棱皮龜、山瑞鱉、大壁虎。

兩棲類，大鯢、細痣疣螈、鎮海疣螈、貴州疣螈、大涼疣螈、細瘰疣螈、虎紋蛙。魚類，黃唇魚、松江鱸魚、克氏海馬魚、胭脂魚、唐魚、大頭鯉、金線鲃、大理裂腹魚、花鰻鱺、川陜哲羅鮭、秦嶺細鱗鮭。