辣椒爛果是影響其品質與產量的重要因素，直接關系到椒農的經濟效益。爛果的發生主要是由辣椒疫病、炭疽病、軟腐病、日灼病和臍腐病等多種疾病引起，針對這些病癥采取相應的防治措施至關重要。辣椒疫病、炭疽病和軟腐病引起的爛果，其癥狀表現為：疫病初期病斑呈暗綠色水浸狀，隨后變褐軟腐，濕度大時表面長出白色霉層，干燥后形成暗褐色僵果；炭疽病引起爛果初期為水浸狀黃褐色長圓斑，邊緣呈褐色，中央灰褐色，有同心輪紋，潮濕時溢出黏稠物，內部組織半軟腐、易干縮；軟腐病引起的病果，初期暗綠色斑，后變褐軟腐，具有惡臭味，果皮變白，果實失水干縮。防治方法包括：提倡與非茄科作物輪作；選用抗病品種，如雞澤羊角椒、干鮮二號等；配方施肥，控施氮肥量；播種前用種衣劑拌種；藥劑防治：疫病可用安克可濕性粉劑800倍液、甲霜·錳鋅可濕性粉劑600倍液等噴霧防治；炭疽病可用25%溴菌清可濕性粉劑500倍液、70%安泰生可濕性粉劑600倍液噴霧防治；防治煙青蟲等蛀果害蟲，可用25%滅幼脲2000倍液+72%可溶性鏈霉素1500倍液防治。日灼病、臍腐病等生理性病害引起的爛果，日灼病主要發生在果實向陽面上，初期為灰白色或淡白色革質狀，病部表皮變薄，組織壞死發硬；臍腐病初現暗綠色水浸狀斑點，后迅速擴大，有時可擴展到近半個果實，患部組織皺縮、表面凹陷，后期常有寄主侵染而表現病害，呈黑褐色和軟腐。防治方法包括：與高稈作物間作，在果實膨大前葉面噴施鈣肥，進行鈣素補充。