該六區有黑龍江流域水資源區、遼河流域水資源區、灤河流域水資源區、黃河流域水資源區、內陸河流域水資源區、青海湖流域水資源區。1、黑龍江流域水資源區：主要包括呼倫貝爾市、興安盟、通遼市、赤峰市等地。2、遼河流域水資源區：主要包括遼寧省和吉林省的內蒙古部分，涉及錫林郭勒盟、烏蘭察布市等地。3、灤河流域水資源區：主要包括河北省和天津市的內蒙古部分，以及內蒙古自治區的錫林郭勒盟、烏蘭察布市等地。4、黃河流域水資源區：主要包括內蒙古自治區的阿拉善盟、烏海市、鄂爾多斯市、巴彥淖爾市、包頭市、呼和浩特市等地。5、內陸河流域水資源區：主要包括內蒙古自治區的額爾古納市、根河市、牙克石市、扎蘭屯市等地。6、青海湖流域水資源區：主要包括青海省和甘肅省的內蒙古部分，以及內蒙古自治區的額濟納旗等地。