城鎮居民基本醫療保險與城鎮職工基本醫療保險在面向對象上有顯著差異。前者面向城鎮所有用人單位及其職工，涵蓋了國有企業、集體企業、外商投資企業、私營企業等各類單位及其職工，同時包括鄉鎮企業及其職工、城鎮個體經濟組織業主及其從業人員，這些單位需按規定參加基本醫療保險。而城鎮居民基本醫療保險則主要針對城鎮居民，特別是未納入城鎮職工基本醫療保險覆蓋范圍的中小學階段學生、少年兒童和其他非從業城鎮居民，允許他們自愿選擇加入。兩者在作用上也有區別。城鎮職工基本醫療保險旨在保障參保人員因疾病治療產生的醫療費用，通過醫療保險經辦機構給予一定的經濟補償，減輕勞動者的經濟負擔。而城鎮居民基本醫療保險則主要負責支付參保居民的住院和門診大病、門診搶救醫療費用，其支付范圍和標準依據城鎮居民基本醫療保險藥品目錄、診療項目和醫療服務設施范圍和標準執行。在繳費比例上，城鎮職工基本醫療保險采取用人單位與職工共同繳納的方式，其中用人單位繳費率約為職工工資總額的6%，職工繳費率為本人工資收入的2%。隨著經濟發展，這兩項繳費率可作相應調整。城鎮居民基本醫療保險則以家庭繳費為主，同時政府給予適當補助，參保居民需按規定繳納基本醫療保險費，有條件單位可以對職工家屬參保繳費給予補助，國家還對個人繳費和單位補助資金制定稅收鼓勵政策。