變更規劃許可條件應當遵循的程序是，建設單位或者個人向城鄉規劃主管部門提出申請，就變更的目的、理由及依據等進行說明；城鄉規劃主管部門就申請變更主要內容進行審核，對不符合控制性詳細規劃的不予批準，對符合控制性詳細規劃批準的變更申請，應及時將變更的規劃條件進行公示并向土地主管部門通報；土地主管部門應當依據變更后的規劃條件與建設單位或者個人重新簽訂國有土地使用權出讓合同，其中非經營性用地改變為經營性用地的，應依法辦理招標、拍賣、掛牌出讓等出讓手續，需補交土地低價差價的應按規定補交地價差價。

【本文所涉及的法律依據】：：《中華人民共和國城鄉規劃法》 第四十三條 建設單位應當按照規劃條件進行建設;確需變更的，必須向城市、縣人民政府城鄉規劃主管部門提出申請。變更內容不符合控制性詳細規劃的，城鄉規劃主管部門不得批準。城市、縣人民政府城鄉規劃主管部門應當及時將依法變更后的規劃條件通報同級土地主管部門并公示。

建設單位應當及時將依法變更后的規劃條件報有關人民政府土地主管部門備案。