非轉基因大豆和轉基因大豆之間存在幾個主要區別：1、基因來源和改造過程不同。非轉基因大豆是通過自然選擇和雜交培育出來的，其基因組保持自然狀態，沒有經過人為的外源基因插入；轉基因大豆則通過基因工程技術，將特定的外源基因如抗蟲、抗藥基因轉入大豆基因組中，以增強某些特性或抵抗病蟲害。2、種植技術和環境影響不同。非轉基因大豆的種植過程更依賴自然條件，可能更接近自然狀態；轉基因大豆由于具有抗病蟲害的特性，可以減少農藥的使用，但可能會影響生態系統的平衡，例如通過對有益昆蟲的影響或與野生植物的雜交。3、外觀和形態不同。轉基因大豆的外觀通常更規則，多為正圓形，顏色較均勻，多為淡黃色，個頭較大，豆臍部位不太明顯，外觀較整潔，少有蟲蛀現象；非轉基因大豆的形狀多為橢圓形，顏色較深，豆臍部位較明顯，成熟過程更長，顏色不那么均勻。4、營養價值和安全性不同。兩種大豆在營養成分上沒有顯著差異，都含有豐富的蛋白質、脂肪、碳水化合物、維生素和礦物質；轉基因大豆的安全性一直是爭議焦點，有研究表明可能對人體健康產生不良影響，如過敏反應、免疫系統紊亂等，但也有研究認為其安全性可以保障，需要更多的科學證據。