現(xiàn)代發(fā)酵工程的應(yīng)用非常廣泛，包括生物制藥、食品、飲料、能源、環(huán)境保護(hù)等領(lǐng)域。以下是幾個(gè)典型的應(yīng)用：

1. 生物制藥：現(xiàn)代生物制藥生產(chǎn)過(guò)程中不可或缺的一部分就是發(fā)酵工程。生物制藥產(chǎn)品有很多種，包括抗生素、蛋白質(zhì)藥物、疫苗等。生物制藥中最常用的生產(chǎn)菌種有大腸桿菌、釀酒酵母、真菌等。

2. 食品加工：發(fā)酵是食品加工過(guò)程中的一個(gè)重要環(huán)節(jié)，如酸奶、腐乳、豆腐、醬油等傳統(tǒng)食品均采用發(fā)酵工藝制作。現(xiàn)代生產(chǎn)中往往采用工業(yè)化的發(fā)酵設(shè)備和控制技術(shù)來(lái)生產(chǎn)更高品質(zhì)的食品。

3. 飲料生產(chǎn)：發(fā)酵在飲料生產(chǎn)中也扮演著重要的角色，如啤酒、酸梅湯等都是通過(guò)發(fā)酵得到的。現(xiàn)代釀造技術(shù)通過(guò)對(duì)酵母菌液的控制，使其產(chǎn)生更多的二氧化碳和酒精，以獲得更好的口感和口感穩(wěn)定性。

4. 能源：現(xiàn)代能源開(kāi)發(fā)中的一種新型生物質(zhì)能源——生物氫的生產(chǎn)利用也需要發(fā)酵技術(shù)。通過(guò)將水中的光合作用產(chǎn)生的氫氣和細(xì)菌中產(chǎn)生的氫氣結(jié)合起來(lái)，發(fā)酵技術(shù)可以高效地生產(chǎn)大量的生物氫。

5. 環(huán)境保護(hù)：發(fā)酵技術(shù)在環(huán)境保護(hù)中也有廣泛應(yīng)用。例如，將微生物應(yīng)用于污染物的降解，利用酵母發(fā)酵減少有機(jī)廢棄物產(chǎn)生的廢氣和廢水等。